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軟件專利和軟件著作權(quán)，二者都屬于知識產(chǎn)權(quán)所保護(hù)的范疇。
依據(jù)的法律不同：
軟件的著作權(quán)保護(hù)依據(jù)《著作權(quán)法》和《計(jì)算機(jī)軟件保護(hù)條例》。
軟件的專利保護(hù)依據(jù)《專利法》，具體審查標(biāo)準(zhǔn)參見國家知識產(chǎn)權(quán)局專利《審查指南》第二部分第九章“涉及計(jì)算機(jī)程序的發(fā)明專利申請審查若干問題”。
保護(hù)原則不同：
軟件著作權(quán)是在軟件創(chuàng)作完成后自動產(chǎn)生的，也是自愿進(jìn)行軟件著作權(quán)登記，登記的目的是體現(xiàn)公證的效力，主要用于聲明著作權(quán)權(quán)屬，同時(shí)使后續(xù)維權(quán)時(shí)的證據(jù)力度更大。
軟件專利則必須向?qū)＠痔岢錾暾埐拍塬@得保護(hù)，因此必須要積極申請，且專利制度也是以“用公開換保護(hù)”為原則。
保護(hù)客體不同：
軟件著作權(quán)申請?zhí)峤坏馁Y料是源代碼及用戶操作手冊，所以軟件著作權(quán)保護(hù)的是表現(xiàn)形式，不保護(hù)思想。這樣就有可能出現(xiàn)競爭對手將你的軟件進(jìn)行研究，然后改變編程語言，達(dá)到的結(jié)果是一樣的，但由于代碼不相同，所以不侵犯著作權(quán)。
軟件專利則不同，在申請時(shí)描述的是軟件的設(shè)計(jì)構(gòu)思（注意一定要以技術(shù)方案的形式表現(xiàn)，或者最好能夠結(jié)合硬件來表現(xiàn)），包含了軟件流程圖的內(nèi)容，而不是主要說明采用哪種程序語言實(shí)現(xiàn)。一旦獲權(quán)后，他人只要采用了軟件專利的設(shè)計(jì)構(gòu)思或方案，就可能構(gòu)成侵權(quán)。
申請通過率不同：
軟件著作權(quán)實(shí)行的是登記制，一般不需要經(jīng)過實(shí)質(zhì)審查，只要形式審查時(shí)提交的材料符合要求，并且不違反《著作權(quán)法》的規(guī)定即可獲權(quán)，登記通過率極高。
軟件專利需要經(jīng)過形式審查和實(shí)際審查。形式審查主要是審核專利材料是否符合申請要求，形式審查通過后就會公開，再進(jìn)入實(shí)質(zhì)審查，審核該專利是否符合《專利法》的要求，并且要滿足新穎性，創(chuàng)造性，實(shí)用性等諸多要求。一般純軟件型的專利不易獲權(quán)，通過軟硬件結(jié)合的方式會提高其授權(quán)率，但總得來說通過率依然不高。
保護(hù)期限和維護(hù)費(fèi)用不同：
公民的作品，其法律規(guī)定的相關(guān)著作權(quán)保護(hù)期為作者有生之年加死亡后50年，法人及其它組織的作品，其法律規(guī)定的相關(guān)著作權(quán)的保護(hù)期為50年。費(fèi)用方面只會繳納前期的申請費(fèi)，后續(xù)不會有維護(hù)的費(fèi)用。
一般來說軟件專利只能申請發(fā)明專利，保護(hù)期限從申請日起算20年。而發(fā)明專利每年都需要繳納年費(fèi)，過期不繳納即視為放棄專利權(quán)。
優(yōu)缺點(diǎn)不同：
軟件著作權(quán)可以不用公開就受到保護(hù)，并且能夠讓創(chuàng)作者快速地獲得著作權(quán)保護(hù)，普通登記一般4個(gè)月左右授權(quán)，采用加急申請軟件著作權(quán)最快能一個(gè)工作日授權(quán)。能夠讓著作權(quán)人快速搶占市場，拿到政府相應(yīng)的資助。
軟件專利必須以公開換保護(hù)，發(fā)明專利申請時(shí)間是1~2年，一般不能采取加急形式。而軟件的進(jìn)步相應(yīng)來說是較快的，所以在申請的過程中的有可能就錯(cuò)過了軟件市場。
