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華大“超級生命計算機(jī)”來了
時間:2018-10-26來源:科技日報

“超級生命計算機(jī)”來了!10月25日,華大集團(tuán)子公司華大智造發(fā)布了其自主研發(fā)的最新超高通量基因測序儀。

  6臺機(jī)器一年可完成10萬人基因組測序

  國家級人群基因組學(xué)研究以及對遺傳資源的保護(hù)與應(yīng)用是精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)的基礎(chǔ),直接影響到一個國家在生物醫(yī)藥領(lǐng)域的核心競爭力。自國際人類基因組計劃之后,各國紛紛推出國家級大規(guī)模人群基因組測序項(xiàng)目。

  由于受到設(shè)備數(shù)量、速度和成本等現(xiàn)實(shí)原因的制約,基因組的測序效率在前幾年推進(jìn)并不順利。以英國為例,2012年12月,英國啟動10萬人基因組計劃,一直到2018年7月,花了5年半的時間才完成7萬多例全基因組測序。

  此次發(fā)布的最新超高通量基因測序儀“MGISEQ-T7”,很可能改變這一現(xiàn)狀。其一天就可以完成60例個人全基因組測序,6臺機(jī)器一年可完成10萬人基因組測序,是目前全球日生產(chǎn)能力最強(qiáng)的基因測序儀,因此被人稱為“超級生命計算機(jī)”。

  “完全突破大家對測序儀的想象。”華大智造首席執(zhí)行官牟峰表示,超快速、超高通量的T7必將對目前測序產(chǎn)業(yè)的發(fā)展起到強(qiáng)有力的推動作用,同時也標(biāo)志著基于基因檢測的精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)研究,全面進(jìn)入大數(shù)據(jù)時代成為可能。

  提速提速再提速

  據(jù)介紹,目前,市場上所有的測序儀最多只能支持兩張芯片同時運(yùn)行,而T7的4聯(lián)芯片平臺采用獨(dú)特的芯片搭載技術(shù),可實(shí)現(xiàn)4張芯片進(jìn)行完全獨(dú)立的測序流程,如同4臺測序儀同時進(jìn)行工作,且芯片間互不影響。

  不僅如此,T7可同時支持全基因組測序、超深度外顯子測序、表觀基因組測序、腫瘤大Panel基因檢測。也就是說,用戶可以按照他們的不同需求隨時隨地進(jìn)行同時測序,并可以最大程度地節(jié)省時間。

  測序儀運(yùn)行速度的快慢將直接影響到測序項(xiàng)目的交付時間,因此,業(yè)界始終致力于提升測序儀的運(yùn)行速度。通過全面升級生化系統(tǒng)、光學(xué)系統(tǒng),并將圖像數(shù)據(jù)處理速度提升15倍,從而使得T7測序速度比行業(yè)最高水平還提升50%以上,僅需不到24小時便可完成PE150。

  T7將原有的芯片密度提高了20%,使得單張芯片即可實(shí)現(xiàn)Tb級數(shù)據(jù)產(chǎn)出。加之4張芯片可同時獨(dú)立運(yùn)行,24小時無休輪轉(zhuǎn),MGISEQ-T7每天最多可產(chǎn)出6Tb數(shù)據(jù)。此外,針對基因測序特殊的要求,華大智造研發(fā)出自動化樣本制備系統(tǒng)MGISP-960,單次最多可自動完成96個樣本的制備,完美支撐了T7測序通量需求,使其強(qiáng)大性能得以更充分體現(xiàn)。

  生命經(jīng)濟(jì)已然成為全球經(jīng)濟(jì)增長的新引擎,基因測序技術(shù)是生命經(jīng)濟(jì)的核心。此前,華大自主研發(fā)的國產(chǎn)化基因測序儀,打破了國外公司對基因檢測市場的壟斷,助力中國基因產(chǎn)業(yè)高端測序技術(shù)的源頭創(chuàng)新和上下游的協(xié)同發(fā)展。T7的發(fā)布,進(jìn)一步鞏固了華大智造作為全球領(lǐng)先的基因測序設(shè)備生產(chǎn)制造商的地位,并使得華大集團(tuán)成為全球唯一一個有能力構(gòu)建一條從硬件制造到基因測序服務(wù),再到大數(shù)據(jù)研究的完整基因測序產(chǎn)業(yè)鏈的機(jī)構(gòu)。(作者:劉傳書)